幾乎每個(gè)生物體都擁有一系列共生微生物-一個(gè)微生物組。現(xiàn)在已經(jīng)認(rèn)識到,微生物群是包括人類在內(nèi)的所有動物健康的主要驅(qū)動力,并且這些共生系統(tǒng)通常表現(xiàn)出強(qiáng)烈的日常節(jié)律。
夏威夷大學(xué)馬諾阿分校的科學(xué)家領(lǐng)導(dǎo)的一項(xiàng)新研究表明,在與夏威夷短尾烏賊Euprymna sco和發(fā)光細(xì)菌費(fèi)氏弧菌之間的互利關(guān)系中,這種免疫蛋白被稱為“巨噬細(xì)胞遷移抑制因子”或“ MIF”,這是日常節(jié)奏的大師。這一發(fā)現(xiàn)發(fā)表在《美國國家科學(xué)院院刊》上,可能為影響人類微生物組節(jié)律的因素提供重要線索,因?yàn)樵诓溉閯游锕采M織中也大量發(fā)現(xiàn)了MIF蛋白。
為了生存,夜間的夏威夷短尾烏賊依靠V. fischeri,這使其能夠模仿海洋表面的月光,并在覓食時(shí)欺騙和尚海豹和其他捕食者。共生細(xì)菌也需要營養(yǎng),尤其是在晚上,當(dāng)它們數(shù)量眾多并且魷魚的偽裝需要它們的光時(shí)。
該研究小組由埃里克·科赫(Eric Koch)領(lǐng)導(dǎo),在研究之時(shí),他是UH馬諾阿海洋與地球科學(xué)技術(shù)學(xué)院(SOEST)太平洋生物科學(xué)研究中心(PBRC)的研究生, MIF是控制稱為血細(xì)胞的專門免疫細(xì)胞運(yùn)動的一種方法,該細(xì)胞為細(xì)菌提供了幾丁質(zhì)。
到了晚上,當(dāng)研究小組發(fā)現(xiàn)魷魚的輕器官中的MIF較低時(shí),血細(xì)胞被允許進(jìn)入細(xì)菌所居住的區(qū)域,甲殼質(zhì)被遞送。白天,MIF很高,這會抑制血細(xì)胞進(jìn)入共生組織并在錯(cuò)誤的時(shí)間傾倒它們的幾丁質(zhì)。
營養(yǎng)素的這種循環(huán)對與共生系統(tǒng)有關(guān)的所有其他節(jié)律都有連鎖反應(yīng)-可能影響整體健康,發(fā)育或繁殖。
近三十年來,PBRC的Margaret McFall-Ngai和Edward Ruby教授一直使用魷魚-細(xì)菌共生系統(tǒng)來表征動物微生物組。
McFall-Ngai說:“自1996年以來,我們已經(jīng)認(rèn)識到魷魚-弧菌共生的日常節(jié)律,但如何控制節(jié)律尚不清楚。”“這項(xiàng)研究使整個(gè)過程成為焦點(diǎn),使我們能夠了解節(jié)奏在動物中的運(yùn)作方式和成熟方式。”
這些發(fā)現(xiàn)可以為理解微生物群落在其他生物體和環(huán)境中的功能鋪平道路。
來源:生物幫
qPCR法介紹:
熒光定量PCR法(qPCR):是在常規(guī)PCR基礎(chǔ)上,將『針對支原體特異性保守序列的探針』做熒光標(biāo)記,使PCR擴(kuò)增后的產(chǎn)物帶有熒光,利用熒光信號的變化和配套軟件,進(jìn)行DNA擴(kuò)增反應(yīng)的實(shí)時(shí)監(jiān)測,簡稱qPCR。
優(yōu)點(diǎn):①靈敏度高、特異性強(qiáng)。
②時(shí)間短,2-3小時(shí)出結(jié)果。
③檢測結(jié)果可定量。
④操作簡便。
缺點(diǎn):①對于已做支原體滅活處理的樣品,由于支原體DNA仍舊存在其中,PCR結(jié)果會出現(xiàn)假陽性。(可用培養(yǎng)法做補(bǔ)充驗(yàn)證)
②不同廠家生產(chǎn)的試劑盒質(zhì)量差異巨大(由于引物及內(nèi)在設(shè)計(jì)不同),需謹(jǐn)慎選擇,盡量在專業(yè)人員推薦指導(dǎo)下使用。